Elle mène au LIDILEM (Laboratoire de LInguistique et DIdactique des Langues Etrangères et Maternelles) des recherches en linguistique de corpus, en particulier sur l’écriture scientifique, son lexique et son organisation. Elle a collaboré au corpus de "Littéracie Avancée", disponible sur Ortolang, qui rassemble des productions écrites d'étudiants de SHS, dans des genres divers. Membre du comité de pilotage du Consortium CORLI, Marie-Paule Jacques participe à l'animation de la communauté de chercheurs autour de la linguistique de corpus et de la linguistique outillée, notamment à travers l'organisation, en 2017 et en 2019, des Journées Internationales de la Linguistique de Corpus.