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Advanced NMR Spectroscopy

Réf. 54010
CatégoriePhysique et chimie
Pour approfondir votre compréhension des expériences RMN !
  • Durée : 6 semaines
  • Effort : 24 heures
  • Rythme: ~4 heures/semaine
  • Langues: Anglais

Ce que vous allez apprendre

À la fin de ce cours, vous saurez :

  • comment fonctionnent les expériences de RMN sur des échantillons liquides;
  • comment les expériences de RMN permettent d'analyser de macromolécules biologiques et de mélanges de métabolites;
  • comment les expériences de RMN peuvent être utilisées pour enregistrer des images en IRM.

Description

Le phénomène RMN est largement utilisé en IRM pour réaliser des images de nos organes et tissus. La spectroscopie RMN est également un outil puissant pour l’analyse des molécules biologiques, telles que les protéines ou les sucres, mais également des mélanges complexes de molécules, notamment dans le cas des approches métabolomiques.

Le MOOC “Advanced NMR Spectroscopy” est le deuxième volet d’une collection de troisMOOC sur la RMN.
Ce cours vise à permettre aux participants d’acquérir une connaissance poussée des expériences RMN.
Il présente, en particulier, les outils et concepts théoriques, tels que les opérateurs-produits, la relaxation et la sélection des chemins de cohérence, nécessaire pour comprendre le fonctionnement des expériences RMN, ainsi que les techniques spécifiques utilisées pour analyser des échantillons de protéines, de sucres, de mélanges de métabolites, ou enregistrer des images IRM.

Ce cours s’adresse aux étudiants de licence, de master et doctorat ainsi qu'aux enseignants et aux professionnels, qui veulent approfondir leur connaissance des expériences RMN.

Format

Vous apprendrez les principes théoriques et les aspects techniques nécessaires pour comprendre les expériences RMN, grâce à des cours filmés.

Ce MOOC, organisé sur 6 semaines, est enseigné et animé en anglais.

Des sous-titres en chinois simplifié et en japonais sont aussi fournis.

Prérequis

Les participants doivent avoir des connaissances de base en spectroscopie RMN et dans l’analyse des petites molécules organiques par cette technique.

Evaluation et Certification

Vos connaissances seront testées par des QCM ainsi qu’un examen final.
Votre note finale sera une moyenne pondérée des notes obtenues aux QCM notés et à l'examen final.
Une note finale supérieure à 65 % est nécessaire pour obtenir le badge de réussite.

Plan de cours

  • Semaine 1 : Operateurs-produits
  • Semaine 2 : Relaxation
  • Semaine 3 : Sélection de cohérences
  • Semaine 4 : RMN des protéines
  • Semaine 5 : TP de RMN des solutions et RMN métabolomique
  • Semaine 6 : RMN des glycanes et IRM

Équipe pédagogique

Olivier Lafon

Catégories

Olivier Lafon est professeur à l’université de Lille et membre honoraire de l’institut universitaire de France (IUF). Ses recherches visent à repousser les frontières de la spectroscopie RMN des solides, afin d’obtenir de nouvelles informations sur les relations structure-propriétés des matériaux utilisés dans le domaine de l’énergie, de la bio-économie et de la santé. Ses sujets de recherche actuels portent notamment sur le développement de nouvelles méthodes de RMN pour l’étude des solides (en particulier à très hauts champs, pour les noyaux quadripolaires ou en utilisant la technique de polarisation dynamique nucléaire (dynamic nuclear polarization, DNP, en anglais) et leur utilisation pour la caractérisation des matériaux, tels que les matériaux pour batterie, les boîtes quantiques, les matériaux photovoltaïques, les catalyseurs hétérogènes et les matériaux poreux. Olivier Lafon est un ancien élève de l’École Normale Supérieure de Lyon et agrégé de sciences physiques. Il a obtenu son mastère et son doctorat à l’université Paris-Saclay. Le comité scientifique de l’Euromar lui a décerné le "Magnetic Resonance in Chemistry Award for Young Scientists" en 2013. Il est responsable scientifique de la plateforme lilloise de RMN très hauts champs, qui comprend un spectromètre RMN 1,2 GHz pour l’étude des liquides et des solides et fait partie de l’infrastructure de recherche INFRANALYTICS. Il coordonne également le réseau français des infrastructures de recherche en sciences de la matière et ingénierie (IR SMI). Il est également membre du comité éditorial de la revue "Solid-State Nuclear Magnetic Resonance".

Robert Schneider

Catégories

Dr Robert Schneider a étudié la biologie et la physique à Munich (Allemagne) et à Cambridge (États-Unis). Pendant sa thèse à l’institut Max Planck de chimie biophysique de Göttingen (Allemagne), il a appliqué la spectroscopie RMN des solides aux protéines membranaires et fibreuses. Ses travaux ont conduit à un modèle structural de l’état désactivé d’un canal potassium ainsi que des fibrilles formées par les peptides polyglutamine. Ses recherches postdoctotales à Institut de Biologie Structurale de Grenoble (France) ont porté sur l’étude par RMN en solution de la cinétique des interactions entre protéines intrinsèquement désordonnées. En 2014, il a été nommé maître de conférences à l’université de Lille, où il a poursuivi ses travaux sur la spectroscopie RMN des protéines membranaires et désordonnées en solution et à l’état solide. Entre avril 2021 et novembre 2023 , il a été ingénieur d’application de la société Bruker Biospin à Fällanden (Suisse) avant de retrouver une position académique depuis 2023 comme chercheur CEA à l'Institut de Biologie Structurale in Grenoble (France).

Luisa Ciobanu

Catégories

Dr Luisa Ciobanu est une neurophysicienne, dont les travaux portent sur l’imagerie par résonance magnétique à ultra-haut-champ pour la compréhension des principes physiques fondamentaux sous-tendant les fonctions biologiques. Elle a obtenu un doctorat de physique à l’université d’état de l’Ohio en 2002. Elle a ensuite effectué un post-doctorat dans le département d’informatique et d’électronique de l’université d’Illinois à Urbana Champaign. Elle a ensuite travaillé en tant que chercheuse au sein de l’institut Beckman, laboratoire commun de cette université et de la société Pfizer, Inc. (Michigan, Ann Arbor). En 2007, elle a rejoint l’institut NeuroSpin au CEA Saclay, où elle dirige l’équipe de neurophysique.

Patrick Giraudeau

Catégories

Dr Patrick Giraudeau est professeur de chimie analytique à l’université de Nantes. Ses activités de recherche au sein du laboratoire CEISAM portent sur le développement de méthodes RMN quantitatives pour l’analyse de mélanges complexes, avec des applications en métabolomique et en fluxomique. Il a notamment développé des expériences RMN multidimensionnelles quantitatives à hauts champs mais aussi pour des spectromètres de paillasse. Il travaille également sur la polarisation dynamique nucléaire par dissolution. Il a obtenu son doctorat à l’université de Nantes en 2008, puis a effectué son post-doctorat à l’institut Weizmann (Israel). En 2009, il a été nommé maître de conférences à l’université de Nantes, puis a été promu professeur des universités en 2017. En 2014, il est devenu membre de l’Institut Universitaire de France et obtenu une bourse consolidator de l’ European Research Council en 2018. Il est éditeur associé de la revue Magnetic Resonance in Chemistry, vice-président du réseau français de métabolomique et de fluxomique (RFMF) et directeur de la plateforme RMN CEISAM-Corsaire-MetaboHUB.

Yann Guérardel

Catégories

Dr Yann Guérardel est un biochimiste dont les recherches portent sur la détermination des relations structure-fonction des glycoconjugués complexes dans différents contextes biologiques, tels que les interactions parasite-hôte et les maladies humaines. Il a obtenu une thèse en biochimie à l’université de Lille et effectué un post-doctorat à l’Academia Sinica de Taipei (Taiwan) et à l’université de Nagoya (Japon) pour développer l’utilisation de la spectroscopie RMN des solutions à hauts champs et de la spectrométrie de masse pour l’analyse structurale des sucres. Il est actuellement directeur de recherche au CNRS et directeur de l’unité de glycobiologie structurale et fonctionnelle (UGSF, UMR CNRS 8576) et professeur associé à l’institut iGCORE de l’université de Gifu (Japon).

Établissements

Université de Lille

  • Afin  d'élargir l'audience de notre mooc des sous-titres en chinois simplifié et en japonais sont fournis. Nous remercions :
    • Ming Shen, associate professor à l’East China Normal University, pour la traduction des sous-titres en chinois simplifié
    • Dr Akiko Sasakipour la traduction des sous-titres en japonais.
  • Nous remercions l'équipe de l'Institut NeuroSpin (CEA) pour la réalisation du TP sur l'IRM (semaine 6), et en particulier :
    • Romain Gaudin, doctorand
    • Florence Mousson, chargé de communication (CEA Joliot)

Licence

Licence pour le contenu du cours

Attribution - Pas d’Utilisation Commerciale - Pas de Modification

Vous êtes autorisé à :

  • Partager — copier, distribuer et communiquer le matériel par tous moyens et sous tous formats

Selon les conditions suivantes :

  • Attribution — Vous devez créditer l'oeuvre, intégrer un lien vers la licence et indiquer si des modifications ont été effectuées à l'oeuvre. Vous devez indiquer ces informations par tous les moyens raisonnables, sans toutefois suggérer que l'offrant vous soutient ou soutient la façon dont vous avez utilisé son oeuvre.
  • Pas d’Utilisation Commerciale — Vous n'êtes pas autorisé à faire un usage commercial de cette oeuvre, tout ou partie du matériel la composant.
  • ​​​​​​​Pas de modifications — Dans le cas où vous effectuez un remix, que vous transformez, ou créez à partir du matériel composant l'oeuvre originale, vous n'êtes pas autorisé à distribuer ou mettre à disposition l'oeuvre modifiée.

Licence pour le contenu créé par les participants du cours

Tous droits réservés

"Tous droits réservés" est une formalité du droit d'auteur indiquant que le détenteur du droit d'auteur se réserve, ou détient pour son propre usage, tous les droits prévus par la loi sur le droit d'auteur.

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