Emerging and re-emerging viruses
Réf. 96015
Ce MOOC vise à fournir des connaissances sur les virus émergents et ré-émergents impliqués dans les épidémies. Il illustre les dernières connaissances sur la pandémie de Covid-19 due au SRAS-CoV-2.
- Durée : 8 semaines
- Effort : 24 heures
- Rythme: ~3 heures/semaine
- Langues: Anglais et français
Ce que vous allez apprendre
À la fin de ce cours, vous saurez :
- identifier les principaux virus impliqués dans l'émergence et la ré-émergence virale,
- expliquer les mécanismes moléculaires et les changements de mode de vie qui favorisent cette émergence,
- discuter des outils de surveillance et de suivi d’une émergence,
- décrire la pandémie actuelle de Covid-19 d’un point de vue virologique, épidémiologique…
Description
Les virus émergents, et ré-émergents constituent un élément majeur parmi les différents agents pathogènes responsables d’épidémies récentes, comme en témoignent les nombreux épisodes récents d’Ebola, chikungunya, grippe, Zika, dengue, SARS ou MERS, ainsi que les épisodes affectant les animaux tels la rage ou la fièvre catarrhale ovine.
Ce MOOC présente les différents virus impliqués dans l’émergence virale, et décrit les mécanismes moléculaires et les conditions responsables d’une telle émergence. Ceux-ci s’étendent tant à l’apparition de mutations virales qu’aux conséquences des changements climatiques, jusqu’à l’impact de l’urbanisation et des changements d’activités et de comportements humains.
Une mention spéciale est faite sur l’approche “Santé Globale” (“One Health”). Ce MOOC fournit également des bases d’épidémiologie virale et de modélisation des épidémies, ainsi que sur la détection, les mesures sanitaires précoces et les mécanismes de contrôle des épidémies. Il porte également sur les stratégies scientifiques et médicales pour prévenir et lutter contre l’émergence virale, et apporte une vision sur la réponse des gouvernements et agences internationales, telle l’Organisation Mondiale de la Santé (O.M.S.), pour contrer et maîtriser les épidémies.
Enfin, il est à souligner que ce MOOC illustre les dernières connaissances relatives à la pandémie en cours du Covid-19. Sont ici présentées des données de virologie, épidémiologie et vaccinologie du Covid-19, ainsi que les dernières découvertes sur les déterminants structurels du Covid-19 pour la conception d’anticorps monoclonaux thérapeutiques. L'impact de l'infection par le Covid-19 sur le système nerveux central est également décrypté.
Pour cette 3e édition, une séquence sur les variants du Sars-CoV-2 (par Sylvie van der Werf) a été ajoutée.
Format
Le MOOC est divisé en 8 chapitres de 4 à 8 sessions. Chaque session comporte une courte vidéo et 2 questions à choix multiple. A la fin de chaque chapitre, 10 à 16 questions à choix multiple (en anglais) vous seront posées. Ces questions vous permettront d’autoévaluer votre compréhension du contenu des sessions du MOOCs. Les vidéos sont en anglais, sous-titrées en anglais et en français.
Ce MOOC prévoit un Forum où vous allez pouvoir déposer toute question sur l'ensemble des chapitres du MOOC.
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Prérequis
Un bon niveau scientifique est recommandé pour suivre ce MOOC (licence en sciences de la vie).
Evaluation et Certification
Pour suivre ce cours, vous avez le choix entre deux formules. Le parcours DECOUVERTE vous donne accès aux vidéos, quiz et échanges sur le forum. Le parcours QUALIFIANT vous donne en plus accès à un examen certifiant.
Parcours Découverte
Si vous optez pour ce parcours, vous aurez accès aux vidéos, aux quiz et aux échanges dans le forum. Ce parcours ne donnera pas lieu à la délivrance d'une attestation. L'inscription est gratuite.
Parcours Qualifiant
En complément des activités proposées dans le parcours DECOUVERTE, le parcours QUALIFIANT vous permettra d'obtenir un certificat. Pour cela, vous devrez suivre un examen surveillé à distance d’une durée d'une heure, consistant en 30 questions à choix multiples (QCM) et d'obtenir 18 bonnes réponses.
Le prix de l’inscription au parcours qualifiant est de 150€.
Obtenir une certification qualifiante est une opportunité pour vous d'obtenir un diplôme. En effet, ce cours est un des MOOCs du programme du Diplôme Numérique des Maladies Infectieuses de l'Institut Pasteur (DNM2IP). Pour en savoir plus, consultez la page web de l'Institut Pasteur, dédiée à ce nouveau diplôme.
Veuillez noter que seul le parcours "qualifiant" donne droit à une certification délivrée par FUN et l'Institut Pasteur. Il n'y aura pas de certificat de suivi, ni pour le parcours "découverte", ni pour le parcours "qualifiant".
Plan de cours
- W1-1 : Introduction générale (Albert Osterhaus, Amsterdam)
W1-2 : Définitions : émergents et ré-emergents (Antoine Gessain, Institut Pasteur)
W1-3 : Principes : vecteurs, hôtes, réservoirs... (Anna-Bella Failloux, Institut Pasteur)
W1-4 : Santé globale (Hervé Bourhy, Institut Pasteur)
- W2-1 : Nouveaux virus identifiés (Marc Eloit, Institut Pasteur)
W2-2 : La grippe aviaire (Jean-Claude Manuguerra, Institut Pasteur)
W2-3 : Virus précédemment connus qui ont acquis des caractères de virulence supplémentaires: virus grippaux 1 et 2 (Sylvie van der Werf, Institut Pasteur)
W2-4: Contrôle de l'hôte sur le virus (Carla Saleh, Institut Pasteur)
- W3-1 : Changements dans l'urbanisation, le comportement humain (Pascal Handschumacher UNISTRA)
W3-2 : Changements climatiques, déforestation, catastrophes naturelles (Joacim Rocklöv (Université d’Umea, Sweden)
W3-3 : Coronavirus : SARS, MERS-CoV (Luis Enjuanes, Madrid)
W3-4 : Fièvre jaune (Nolween Jouvenet, Institut Pasteur)
W3-5 : Hantavirus et fièvre de Lassa (Noel Tordo, Institut Pasteur)
W3-6 : Le contact humain-non humain avec les primates comme moteur de l'émergence virale (Tamara Gilles-Vernick)
- W4-1: Maladies à Bornavirus (Hilde Angermeier, Institut Pasteur EUPHEM)
W4-2: Le virus Nipah (Birgit Nikolai)
W4-3: La Dengue (Marie Flamand, Institut Pasteur)
W4-4: La fièvre de la vallée du Rift (Benjamin Brennan, Glascow)
W4-5: Virus Crimée-Congo (Claudia Filippone, Institut Pasteur Madagascar)
W4-6: L'hépatite E (Nicole Pavio, ANSES Maisons-Alfort)
- W5-1: Phylogénie et virus (Noël Tordo, Institut Pasteur)
W5-2: L'épidémiologie de Zika (Arnaud Fontanet, Institut Pasteur)
W5-3: L'épidémiologie de l'hépatite C en Egypte (Arnaud Fontanet, Institut Pasteur)
W5-4: Ebola et Marburg (Noël Tordo, Institut Pasteur Guinée)
W5-5: Quasi-Espèces et virus (Esteban Domingo, Madrid)
W5-6: Modélisation de l'épidémiologie de l'infection virale (Simon Cauchemez, Institut Pasteur)
- W6-1 : Surveillance des vecteurs (Norbert Becker, Heidelberg)
W6-2 : Surveillance des maladies virales(Harold Noël, Santé Publique France)
W6-3 : Epidémiologie moléculaire (Antoine Gessain, Institut Pasteur)
W6-4 : CIBU et Arbovirus (Jessica Vanhomwegen, Institut Pasteur)
- W7-1: Activités de contrôle des vecteurs (Norbert Becker, Heidelberg)
W7-2: Préparation (Marie-Paule Kieny, Inserm)
W7-3: Action de santé publique: de la science à la politique (Didier Houssin, DGS)
W7-4: Vaccins (Frédéric Tangy, Institut Pasteur)
W7-5: Therapeutique (Etienne Decroly, AFMB Polytech, Luminy)
W7-6: Liste des maladies prioritaires du plan directeur de l'OMS (Marie-Paule Kieny, OMS)
- W8-1 : Covid19 - Virology (Olivier Schwartz)
W8-2 : Covid19 - Epidemiology (Arnaud Fontanet)
W8-3: Covid19 - SARS-Cov2 variants (Sylvie van der Werf)
W8-4 : Covid19 - Structure and Monoantibodies Therapy (Felix Rey)
W8-5 : Covid19 - Covid19 and its impact on the CNS (Guilherme Dias De Melo)
W8-3: Covid19 - Vaccinology (Christiane Gerke)
Équipe pédagogique
Jean-Pierre Vartanian
Catégories
Jean-Pierre Vartanian est Directeur de Recherche à l’Institut Pasteur dans le département de Virologie. Il est le co-directeur du cours de Virologie Fondamentale à l’Institut Pasteur.
Pierre-Emmanuel Ceccaldi
Catégories
Pierre-Emmanuel Ceccaldi est chef de Groupe dans l’Unité Epidémiologie et Physiopathologie des Virus Oncogènes Institut Pasteur.
Maxime Chazal
Catégories
Ingénieur de recherche dans la Signalisation Antivirale de l’Institut Pasteur spécialisé dans l’étude de virus émergents, la réponse immunitaire innée
Hilde Angermeier
Catégories
Hilde Angermeier est microbiologiste au sein de la formation en microbiologie de la santé publique européenne.
Établissements
Partenaires
Fondation Ipsen
Avec le soutien de la Fondation Ipsen sous l'égide de la Fondation de France
LabEx IBEID
Avec le soutien du LabEx Biologie Intégrative des Maladies Infectieuses Emergentes (Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - IBEID)
Licence
Licence pour le contenu du cours
Attribution - Pas d’Utilisation Commerciale - Pas de Modification
Vous êtes autorisé à :
- Partager — copier, distribuer et communiquer le matériel par tous moyens et sous tous formats
Selon les conditions suivantes :
- Attribution — Vous devez créditer l'oeuvre, intégrer un lien vers la licence et indiquer si des modifications ont été effectuées à l'oeuvre. Vous devez indiquer ces informations par tous les moyens raisonnables, sans toutefois suggérer que l'offrant vous soutient ou soutient la façon dont vous avez utilisé son oeuvre.
- Pas d’Utilisation Commerciale — Vous n'êtes pas autorisé à faire un usage commercial de cette oeuvre, tout ou partie du matériel la composant.
- Pas de modifications — Dans le cas où vous effectuez un remix, que vous transformez, ou créez à partir du matériel composant l'oeuvre originale, vous n'êtes pas autorisé à distribuer ou mettre à disposition l'oeuvre modifiée.
Licence pour le contenu créé par les participants du cours
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