ImageInLife - Imaging the Vertebrate embryo: from biological material to modelling
Réf. 08019
Learn how to image developmental & biological processes at cellular or subcellular resolution in a complete organism.
- Durée : 5 semaines
- Effort : 10 heures
- Rythme: ~2 heures/semaine
- Langues: Anglais
Ce que vous allez apprendre
À la fin de ce cours, vous saurez :
- How to get vertebrate embryos to be imaged
- How to label embryos and larvae for imaging
- How to choose the right microscope for your purpose
- How to deal with both the type of data generated and with the large amount of images/data generated by your microscope
- How to choose the right modeling tools and what modelling could bring to the experimental plans and to the understanding of the underlying biological processes.
Description
Microscopy technologies have progressed to such a point that it is now possible to image a developing vertebrate at the single cell resolution. Two main model species are being used for such studies, the zebrafish and the mouse.
The present MOOC introduces the trainees to these two animal models, to the most modern microscopy technologies, to the use of high volume of data (images) and to the modelling of the studied processes. Trainees will also be introduced to the intravital study of viral infections.
The MOOC gives both a general introduction and introduces to more specialized tools and concepts.
Format
The MOOC is made of 5 weeks of electronic lessons, and you will be offered quizzes to evaluate your performances
Prérequis
The target audience are :
- Students in their first years at the University, before graduating a Bachelor, in order for them to be introduced to the challenges of intravital imaging in vertebrates before their first laboratory internship.
- Master students interested in these disciplines or graduated students and researchers that want to implement research projects in these disciplines.
Prerequisite : Basic knowledge in biology
Evaluation et Certification
At the end of each week, quizzes are available to evaluate your acquired knowledge.
Plan de cours
- Week 1 : Preparing embryos for imaging
- Week 2 : What to image; Labelling techniques
- Week 3 : How to image, Microscopes
- Week 4 : From images to data
- Week 5 : Modelling
Équipe pédagogique
Tamara Sipka
Catégories
from Serbia, Marie Skłodowska-Curie PhD student at the University of Montpellier, France
Salomé Muñoz
Catégories
from Chile, Marie Skłodowska-Curie PhD student at Leiden University, The Netherlands
Radoslaw Gora
Catégories
from Poland, Marie Skłodowska-Curie PhD student at Leiden University, The Netherlands
Matteo Bernardello
Catégories
from Italy, Marie Skłodowska-Curie PhD student at ICFO, Barcelona, Spain
Joel Dokmegang
Catégories
from Cameroon, Marie Skłodowska-Curie PhD student at Manchester Metropolitan University, UK
Laurent Thomas
Catégories
from France, Marie Skłodowska-Curie PhD student at Acquifer, Heidelberg, Germany
Polycarp Okock
Catégories
from Kenya, Marie Skłodowska-Curie PhD student at TatraMed, Bratislava, Slovakia
Valerio Laghi
Catégories
from Italy, Marie Skłodowska-Curie PhD student at Institut Pasteur, Paris, France
Établissements
Partners
Licence
Licence pour le contenu du cours
Attribution - Partage dans les Mêmes Conditions
Vous êtes autorisé à :
- Partager — copier, distribuer et communiquer le matériel par tous moyens et sous tous formats
- Adapter — remixer, transformer et créer à partir du matériel pour toute utilisation, y compris commerciale.
Selon les conditions suivantes :
- Attribution — Vous devez créditer l'oeuvre, intégrer un lien vers la licence et indiquer si des modifications ont été effectuées à l'oeuvre. Vous devez indiquer ces informations par tous les moyens raisonnables, sans toutefois suggérer que l'offrant vous soutient ou soutient la façon dont vous avez utilisé son oeuvre.
- Partage dans les Mêmes Conditions — Dans le cas où vous effectuez un remix, que vous transformez, ou créez à partir du matériel composant l'oeuvre originale, vous devez diffuser l'oeuvre modifiée dans les même conditions, c'est à dire avec la même licence avec laquelle l'oeuvre originale a été diffusée.
Licence pour le contenu créé par les participants du cours
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- Attribution — Vous devez créditer l'oeuvre, intégrer un lien vers la licence et indiquer si des modifications ont été effectuées à l'oeuvre. Vous devez indiquer ces informations par tous les moyens raisonnables, sans toutefois suggérer que l'offrant vous soutient ou soutient la façon dont vous avez utilisé son oeuvre.
- Partage dans les Mêmes Conditions — Dans le cas où vous effectuez un remix, que vous transformez, ou créez à partir du matériel composant l'oeuvre originale, vous devez diffuser l'oeuvre modifiée dans les même conditions, c'est à dire avec la même licence avec laquelle l'oeuvre originale a été diffusée.