La métabolomique : enjeux technologiques et scientifiques
Réf. 136001
- Durée : 5 semaines
- Effort : 20 heures
- Rythme: ~4 heures/semaine
- Langues: Français
Description
usemetabo : le mooc est produit par le Centre National de Recherche Scientifique, l'Institut Français de Bioinformatique , l'Institut National de la Recherche Agronomique , en partenariat avec l'Université de Rennes 1 . Il propose à la communauté francophone de découvrir la métabolomique, une nouvelle démarche scientifique et méthodologique.
Tous les êtres vivants - cellules, animaux, végétaux, champignons - possèdent un métabolisme, c’est-à-dire l’ensemble des réactions biochimiques qui se déroulent en leur sein . La métabolomique s’attache à identifier et à quantifier de façon exhaustive - et non sélective - tous les métabolites d’un système biologique. Issue de l'ère post-génomique et en constante évolution, cette démarche se situe au croisement de la chimie analytique, la bioinformatique, les statistiques et la biologie. Elle s'applique à tous les domaines des Sciences de la Vie : Santé, Biotechnologies, Environnement, Alimentation, Agriculture.
S’appuyant sur des techniques sophistiquées comme la spectrométrie de masse ou la spectrométrie par résonance magnétique nucléaire, la métabolomique apporte des solutions technologiques et offre de nouvelles perspectives scientifiques : un essai clinique sur près de 1000 patients entre 2008 et 2010 a démontré par exemple son efficacité dans le diagnostic précoce et non évasif de certains types de cancer, un horizon très encourageant à moyen terme pour des millions de personnes. La métabolomique fait ainsi émerger de nouveaux horizons économiques et sociétaux majeurs.
- Vous êtes étudiant de Sciences (Licence ou Master de Biologie, Chimie, Mathématiques, Physique, Informatique, etc.) et vous souhaitez en savoir plus sur la métabolomique ?
- Vous êtes chercheur, enseignant-chercheur, ingénieur, ou technicien ? Et vous souhaitez vous familiariser avec la métabolomique pour l'intégrer dans votre projet de recherche ?
- Vous êtes chef d'entreprise ou acteur de l'industrie ? La métabolomique vous interpelle et vous hésitez à faire le pas ?
La maîtrise des concepts, des outils et des méthodologies, et la capacité à intégrer cette démarche dans vos projets constituent un enjeu de formation capital.
20 contributeurs, enseignants et chercheurs, choisissent aujourd'hui de vous accompagner vers les enjeux scientifiques de demain !
Format
Vous prenez part à des activités pédagogiques variées au cours des 5 semaines du mooc : ressources, entraînements, manipulations de logiciels, conseils, discussions, synthèses et ouvertures sur les professions de terrain.
Prérequis
Le mooc usemetabo est totalement ouvert. Il s'adresse à des participants débutants ou confirmés. Des connaissances scientifiques en Biologie, Chimie, Mathématiques, Physique ou Informatique de fin de Licence ou Master sont conseillées pour suivre le cours.
Lectures préparatoires
Afin d'entrer dans la thématique de cours, nous vous proposons la lecture libre de deux articles introductifs :
Lecture 2 : Profils suspects sous surveillance.
Evaluation et Certification
Quiz hebdomadaire en semaines 1, 2 et 3.
En semaine 4 : Quiz, T.P., étude de cas, et synthèse évaluée par les participants. (La semaine 5 comprend essentiellement le temps d'évaluation de 3 synthèses par chaque participant).
Attestation de suivi avec succès délivrée en fin de MOOC sur obtention d’au moins 60% des points. Une mention peut-être apposée à l'attestation :
"Excellent" pour un score supérieur ou égal à 90 % des points
"Très bien" pour un score supérieur ou égal à 80 % des points
"Bien" pour un score supérieur ou égal à 70 % des points.
Plan de cours
- Semaine 1 : LA METABOLOMIQUE : DEFINITION, METHODES ET USAGES
- Semaine 2 : ACQUERIR DES DONNEES ET UTILISER LES PLATEFORMES
- Semaine 3 : ANALYSER ET TRAITER L'INFORMATION
- Semaines 4 & 5 : PRATIQUER LA METABOLOMIQUE
Équipe pédagogique
Julien Boccard
Catégories
Collaborateur scientifique au sein du laboratoire des Sciences Analytiques de l’Université de Genève.
BERNADETTE GOVAERTS
Catégories
Enseignante et chercheur en (bio)statistique à l’Université Catholique
BRUNO LE BIZEC
Catégories
Professeur à l'Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes et directeur du LABERCA, Unité mixte de recherche Oniris/INRA
DOMINIQUE ROLIN
Catégories
Professeur à l'Université de Bordeaux et professeur invité à l'Université de Tsukuba
Établissements
Intervenants
Sandrine AROS
CEA, Medday
Catherine BENNETAU-PELISSERO
INRA
Bruno DESPREZ
Ets Florimond-Desprez
Philippe HANCE
Université de Lille, Ets Florimond-Desprez
Jean-Louis HILBERT
Université de Lille
Yves LE BOUC
Agence Française de Lutte contre le Dopage
Florence MONDEGUER
IFREMER
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Partenaires
Centre National de la Recherche Scientifique
Institut Français de Bioinformatique
Institut National de la Recherche Agronomique
Université de Rennes 1
Infrastructure Nationale de Métabolomique et Fluxomique
Réseau Francophone de Métabolomique et de Fluxomique
Organismes et établissements associés
Commissariat à l'énergie atomique (CEA)
Laboratoire d'Etude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA)
Museum National d'Histoire Naturelle (MNHN)
Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l’Alimentation (Oniris)
Université de Bordeaux
Université catholique de Louvain
Université de Genève
Université de Montpellier
Université de Nantes
Dédicace
Ce mooc est dédié à Christophe CARON qui fut le moteur et l'animateur de ce projet. Il aura profondément marqué la communauté bioinformatique et notamment l'Institut Français de Bioinformatique, dont il fut pionnier par de nombreuses actions.
Conception et Réalisation pédagogique et technique
Service universitaire de pédagogie et des TICE de l'université de Rennes 1
Licence
Licence pour le contenu du cours
Tous droits réservés
"Tous droits réservés" est une formalité du droit d'auteur indiquant que le détenteur du droit d'auteur se réserve, ou détient pour son propre usage, tous les droits prévus par la loi sur le droit d'auteur.
Licence pour le contenu créé par les participants du cours
Attribution - Pas d’Utilisation Commerciale - Pas de Modification
Vous êtes autorisé à :
- Partager — copier, distribuer et communiquer le matériel par tous moyens et sous tous formats
Selon les conditions suivantes :
- Attribution — Vous devez créditer l'oeuvre, intégrer un lien vers la licence et indiquer si des modifications ont été effectuées à l'oeuvre. Vous devez indiquer ces informations par tous les moyens raisonnables, sans toutefois suggérer que l'offrant vous soutient ou soutient la façon dont vous avez utilisé son oeuvre.
- Pas d’Utilisation Commerciale — Vous n'êtes pas autorisé à faire un usage commercial de cette oeuvre, tout ou partie du matériel la composant.
- Pas de modifications — Dans le cas où vous effectuez un remix, que vous transformez, ou créez à partir du matériel composant l'oeuvre originale, vous n'êtes pas autorisé à distribuer ou mettre à disposition l'oeuvre modifiée.